La chinina è usata come farmaco antimalarico ed è il principio attivo negli estratti della cinchona che sono stati utilizzati a tale scopo da prima del 1633.
2.la chinina è anche un antipiretico e analgesico delicato ed è stata utilizzata in comuni preparazioni fredde a tale scopo.
La chinina è stata usata comunemente e come amaro e aromatizzante, ed è ancora utile per il trattamento della babesiosi.
La chinina è utile anche in alcuni disturbi muscolari, in particolare crampi alle gambe notturni e miotonia congenita, a causa dei suoi effetti diretti sulla membrana e sui canali del sodio. I meccanismi dei suoi effetti antimalarici non sono ben compresi.